ジェノパール®は従来型の平板上表面にDNAが固定された二次元アレイとは異なり、体積のある三次元高含水ゲル中にキャプチャープローブDNAを分散して固定しています(下図参照)。これによって、DNA同士の「静電的反発によるハイブリダイゼーション効率の低下」などを招くことなく、多くのキャプチャープローブDNAを搭載することができます。
また、このキャプチャープローブDNAは、分子運動性がフレキシブルであることから、ハイブリダイゼーション反応時に必要な「分子のコンホメーション変化」が容易となっています。これにより、正常なハイブリダイゼーション反応が進行し、正確なデータを再現性良く取得することができるのです。

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